PCR-analyysin inhibitiot elintarviketeollisuuden patogeenitutkimuksissa
Salonen, Emilia (2024)
Salonen, Emilia
2024
All rights reserved. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2024092425572
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2024092425572
Tiivistelmä
Patogeenitutkimukset ovat tärkeä osa elintarviketeollisuuden valvontaa. Nopein ja yksinkertaisin tapa patogeenien havaitsemiseen on PCR-analyysi. Aina PCR-reaktio ei kuitenkaan onnistu. Reaktion epäonnistuessa laite antaa tulokseksi inhibition, jolloin patogeenin mahdollista läsnäoloa on tutkittava uudestaan. Tässä opinnäytetyössä tutkittiin inhibitioiden esiintymistä PCR-analyyseissä. Tutkimus tehtiin Atria Suomi Oy:lle. Tavoitteena oli löytää heidän laboratorionsa patogeenianalyyseihin liittyviä inhiboivia tekijöitä, jotta näytteistä saataisiin mahdollisimman vähän inhibitiotuloksia.
Inhibitioita aiheuttavia tekijöitä etsittiin kirjallisuudesta, ja lisäksi laboratorion sisäisistä tiedoista, kuten aiemmista PCR-analyysien tuloksista ja henkilökunnan työskentelytavoista. Tämä opinnäytetyö sisältää katsauksen yleisimpiin elintarvikkeista tutkittaviin patogeeneihin sekä PCR-menetelmään, PCR-analyysia inhiboivia tekijöitä sekä kokeellisen osion, jossa aiheuttajia etsittiin laboratoriossa. Opinnäytetyö sisältää salaista tietoa laboratorion sisäisiä asioita koskien, jonka vuoksi julkisesta versiosta puuttuu tulokset sekä käytetyn PCR-laitteen tarkemmat tiedot.
Merkittäviä uusia inhibitioiden aiheuttajia ei Atrian laboratorion kannalta tutkimuksessa löydetty. Kuitenkin joistain löydöksistä voitaisiin tehdä jatkotutkimuksia, mikä saattaisi antaa hyödyllisiä tuloksia aiheesta.
Inhibitioita aiheuttavia tekijöitä etsittiin kirjallisuudesta, ja lisäksi laboratorion sisäisistä tiedoista, kuten aiemmista PCR-analyysien tuloksista ja henkilökunnan työskentelytavoista. Tämä opinnäytetyö sisältää katsauksen yleisimpiin elintarvikkeista tutkittaviin patogeeneihin sekä PCR-menetelmään, PCR-analyysia inhiboivia tekijöitä sekä kokeellisen osion, jossa aiheuttajia etsittiin laboratoriossa. Opinnäytetyö sisältää salaista tietoa laboratorion sisäisiä asioita koskien, jonka vuoksi julkisesta versiosta puuttuu tulokset sekä käytetyn PCR-laitteen tarkemmat tiedot.
Merkittäviä uusia inhibitioiden aiheuttajia ei Atrian laboratorion kannalta tutkimuksessa löydetty. Kuitenkin joistain löydöksistä voitaisiin tehdä jatkotutkimuksia, mikä saattaisi antaa hyödyllisiä tuloksia aiheesta.