Geenikloonaus bakteerisolussa: laboraatiotunnin kokoaminen ja työohjeen laatiminen bioanalyytikko-opiskelijoille
Anttinen, Sonja; Hathaway, Tanya (2022)
Anttinen, Sonja
Hathaway, Tanya
2022
All rights reserved. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2022120125639
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2022120125639
Tiivistelmä
Kloonauksella tarkoitetaan jonkin tietyn organismin kopioimista, jolloin syntyvä uusi elävä organismi on identtinen perimältään alkuperäisen organismin kanssa. Geenikloonauksessa haluttu DNA-fragmentti liitetään vektoriin, esimerkiksi plasmidiin, jolloin saadaan yhdistelmä-DNA, joka siirretään isäntäsoluun. Kun halutaan kloonata geenejä, käytetään isäntäsoluna usein bakteeria, yleisimmin Escherichia coli -bakteeria, kuten myös tässä opinnäytetyössä käytettiin.
Opinnäytetyön tarkoituksena oli pystyttää Metropolia Ammattikorkeakoululle täysin uusi menetelmä, geenikloonaus bakteerisolussa. Opinnäytetyön tilaajana toimi Metropolia Ammattikorkeakoulu. Tarkoituksena oli myös suunnitella laboraatiotunti ja laatia sitä tukeva suomenkielinen työohje. Opinnäytetyön tavoitteena oli lisätä opiskelijoiden oppimista ja ymmärrystä kloonaukseen ja sen menetelmiin liittyen sekä saada kloonaus osaksi bioanalyytikko-opiskelijoiden molekyyligenetiikan opintojakson laboraatiotunteja.
Opinnäytetyö toteutettiin toiminnallisena kehittämistyönä. Tässä opinnäytetyössä keskityttiin kehittämiskysymykseen, voidaanko molekyyligenetiikan opintojaksolla toteuttaa kloonausta käsittelevä laboraatiotunti? Menetelmä rakennettiin tietoperustan pohjalta ja sitä testattiin kahden viikon jaksolla useita kertoja. Menetelmän valintaa ohjasi kustannustehokkuus ja saatavilla olevat resurssit. Menetelmäksi valikoitui perinteinen kloonaus, jonka vaiheita olivat digestio, defosforylaatio, ligaatio, lämpöshokkitransformaatio sekä kloonauksen onnistumisen havainnointi, joka tehtiin antibioottia sisältävällä viljelymaljalla. Toiminnan kulku kuvattiin tarkasti raportissa.
Käytössä olleiden resurssien puitteissa saadut tulokset jäivät epäselviksi ja menetelmä tarvitsee jatkokehittelyä. Tuloksia voidaan hyödyntää menetelmän jatkokehittelyssä kehittämisehdotuksia hyödyntäen, kuten käyttämällä kaupallisia plasmideja ja kompetentteja bakteerisoluja.
Opinnäytetyön tarkoituksena oli pystyttää Metropolia Ammattikorkeakoululle täysin uusi menetelmä, geenikloonaus bakteerisolussa. Opinnäytetyön tilaajana toimi Metropolia Ammattikorkeakoulu. Tarkoituksena oli myös suunnitella laboraatiotunti ja laatia sitä tukeva suomenkielinen työohje. Opinnäytetyön tavoitteena oli lisätä opiskelijoiden oppimista ja ymmärrystä kloonaukseen ja sen menetelmiin liittyen sekä saada kloonaus osaksi bioanalyytikko-opiskelijoiden molekyyligenetiikan opintojakson laboraatiotunteja.
Opinnäytetyö toteutettiin toiminnallisena kehittämistyönä. Tässä opinnäytetyössä keskityttiin kehittämiskysymykseen, voidaanko molekyyligenetiikan opintojaksolla toteuttaa kloonausta käsittelevä laboraatiotunti? Menetelmä rakennettiin tietoperustan pohjalta ja sitä testattiin kahden viikon jaksolla useita kertoja. Menetelmän valintaa ohjasi kustannustehokkuus ja saatavilla olevat resurssit. Menetelmäksi valikoitui perinteinen kloonaus, jonka vaiheita olivat digestio, defosforylaatio, ligaatio, lämpöshokkitransformaatio sekä kloonauksen onnistumisen havainnointi, joka tehtiin antibioottia sisältävällä viljelymaljalla. Toiminnan kulku kuvattiin tarkasti raportissa.
Käytössä olleiden resurssien puitteissa saadut tulokset jäivät epäselviksi ja menetelmä tarvitsee jatkokehittelyä. Tuloksia voidaan hyödyntää menetelmän jatkokehittelyssä kehittämisehdotuksia hyödyntäen, kuten käyttämällä kaupallisia plasmideja ja kompetentteja bakteerisoluja.