PoC: Pilvipalveluun tallennettavan terveystiedon parsiminen Pythonilla

Abstract

Opinnäytetyön aiheena oli Pilvipalveluun tallennettavan terveystiedon parsiminen Pythonilla. Työssä tutustutaan mHealthiin, pilvipalveluihin sekä proof of conceptin toteuttamiseen vaadittavaan teknologiaan.

Työn tavoitteena oli suorittaa proof of concept, jossa BCG-anturista (Ballistocardiography) saatu terveysdata parsitaan Python-ohjelmointikielellä ja siirretään MySQL-tietokantaan. BCG-anturi on erittäin herkkä kiihtyvyysanturi, joka mittaa sydämen sykkimisestä aiheutuvia kiihtyvyyksiä. Suoritettu työ on osa isompaa kokonaisuutta, jossa anturista saatava informaatio saatetaan pilveen asti ja visualisoidaan. Työ toteutettiin osana Metropolian IoT-projektia.

Koko projektissa on Metropolian lisäksi Aalto-yliopisto, Murata Electronics, HUS (Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiiri) sekä NurseBuddy. Koko projektin tavoitteena on luoda terveydenhuollon henkilökunnan käyttöön mobiilia, non-invasiivista teknologiaa, joka auttaa potilaiden terveydentilan seurannassa.

Työn teoriaosuus toteutettiin käyttämällä Metropolian kirjaston e-kirjoja, Google Scholaria sekä projektin mukana tullutta materiaalia. Työn käytännön osuus suoritettiin projektista saadulla kannettavalla tietokoneella, johon asennettiin tarvittavat ohjelmat, jotka olivat MySQL-tietokanta, Python-ohjelmointikieli sekä Muratan anturin ohjelmisto.

Tuloksena saatiin toimiva Python-ohjelma, jonka avulla terveystietoa voidaan parsia ja tallentaa tietokantaan. Saatuja tuloksia voidaan hyödyntää projektin edetessä ja kirjoitettua ohjelmaa voidaan käyttää tulevien ohjelmaversioiden runkona. Työn teoriaosuus hyödyttää IoT-projektiin tulevaa uutta projektityöntekijää tai asiakasta hahmottamaan, mistä IoT-projektissa on kokonaisuudessaan kyse sekä siitä, mitkä ovat projektin tavoitteet.

The subject of this thesis focuses on creating a Proof of Concept for parsing mHealth sensor’s health data with Python and storing this data into the cloud. This thesis explores mHealth, cloud computing and technology for creating the proof of concept.

The objective of this study was to perform a proof of concept in which health data gathered from BCG (Ballistocardiography) bed sensor is parsed with Python programming language and then sent to the MySQL database. A BCG-sensor is a very sensitive accelerometer, which measures the signals gathered from the pulsation of the heart. The work is part of a bigger entity in which the objective is to gather health data from a bed sensor and send it into the cloud which is then visualized. The thesis was conducted as one part of Metropolia’s IoT project.

The whole project consists of five organizations including Metropolia UAS, Aalto University, HUS (Helsinki’s and Espoo’s health care district), Murata Electronics and NurseBuddy. The object of the whole project was to create technology to health care personnel which utilizes mobile and noninvasive technology that helps to monitor patients’ state of health.

The theoretical part of the thesis was put together by using Metropolia library’s e-books, Google Scholar and material from the project. The practical part of the thesis was implemented with a laptop that had the necessary applications installed. The necessary applications were MySQL database, Python object oriented code language and Murata’s software for the health sensor.

Based on the findings of this thesis, a working Python program, which parses the health data and saves it into the database, was created. The program can be implemented in the upcoming versions of code needed to build the framework for the project in getting the health data into the cloud. The theoretical part can be utilized by both new project workers and customers. It is especially helpful for understanding the bigger picture and the objectives of the project.